推拿時，應按順序依次操作，以免遺漏。應先輕手法，如推、揉、運等，后重手法，如掐、捏、拿等；先頭面，次上肢，再下肢，最后是胸腹腰背。
小兒推拿所使用的穴位，根據其手法操作可分為直線、旋轉及垂直方向，可根據操作方向來決定補瀉原則。
1.直線方向
主要是應用推、捏等法施于直線狀穴位。總的補瀉原則是：順時針方向旋轉為瀉，逆時針方向旋轉為補，來回推為平補平瀉法。有些非特定穴在經絡線上，它們共同的補瀉原則是：順經方向推為補，逆經方向推為瀉，來回推為平補平瀉。
2.旋轉方向
多用于揉、運、摩等手法，施于面、點狀穴位。總的補瀉原則是：順時針方向旋轉為補，逆時針方向旋轉為瀉，雙向旋轉為平補平瀉。如果是左右對稱的兩個穴位時，其補瀉原則為：向內旋轉為補，向外旋轉為瀉，雙向旋轉為平補平瀉。
3.垂直方向
多用于按、掐、拿等手法，施于點狀穴位。其補瀉原則以手法的輕重定補瀉，重手法為瀉法，輕手法為補法，不輕不重為平補平瀉。
此外，還有一些穴位的操作方向為特定的，不受以上補瀉原則約束，例如推三關、清天河水等。